弱精子症的药物治疗主要分为特异性治疗和非特异性治疗，需要根据治疗方法的不同选择具体的治疗药物：
1.特异性药物治疗主要是针对已知病因的情况进行原发疾病的治疗，可以改善生育能力。一旦病因明确，可以采用针对病因的特异性治疗，多数治疗是应该有良好的结果的。如性腺炎症引起的弱精子症，可以针对炎症进行抗感染治疗。
2.非特异性药物治疗主要是由于很多弱精子症找不到原因，这时候可以给予经验治疗比如采用锌制剂促进精子生成，采用维生素E、叶酸等对抗精子凋亡。
此外还可以选择抗氧化治疗，对精子生成以及精子的结构和功能保护有重要意义，如硫辛酸、谷胱甘肽等药物；改善细胞能量代谢的治疗，能够改善精子形成和成熟过程，如左卡尼汀；改善微循环的治疗，能够增加精子活力，如七叶皂苷类、胰激肽原酶等。